Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TMEM229B-207ENST00000557006 3941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MYCBPQ99417 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms