Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RPS6KC1Q96S38 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms