Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
COG3Q96JB2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms