Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MYRIPQ8NFW9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYRIPQ8NFW9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms