Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PLD3Q8IV08 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PLD3Q8IV08 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms