Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MARCH9Q86YJ5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms