Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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TRAPPC6BQ86SZ2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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