Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LPCAT2Q7L5N7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LPCAT2Q7L5N7 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms