Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CARMIL2Q6F5E8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms