Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms