Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LGSNQ5TDP6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LGSNQ5TDP6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms