Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UBAP2Q5T6F2 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms