Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PITRM1Q5JRX3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms