Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 LANCL1-205ENST00000443314 4781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AL391845.2-201ENST00000443930 1954 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ATP13A2-203ENST00000452699 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PSAP-201ENST00000394934 2830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC6A1-201ENST00000287766 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DDX54-201ENST00000306014 4377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 LENG8-201ENST00000326764 3991 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 VENTX-201ENST00000325980 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 CACNA1G-218ENST00000507510 7014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB27A-201ENST00000336787 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 PAM-203ENST00000346918 3302 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
KRTAP25-1Q3LHN0 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms