Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TWISTNBQ3B726 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms