Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SPHKAPQ2M3C7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPHKAPQ2M3C7 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms