Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CLPPQ16740 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms