Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HIF1AQ16665 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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