Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SGCAQ16586 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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SGCAQ16586 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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SGCAQ16586 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SGCAQ16586 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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