Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TCEA2Q15560 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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