Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CEP68-202ENST00000377990 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SMCO1Q147U7 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SMCO1Q147U7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SMCO1Q147U7 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SMCO1Q147U7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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