Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
MELKQ14680 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
MELKQ14680 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
MELKQ14680 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms