Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PKP1Q13835 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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