Protein–RNA interactions for Protein: Q13751

LAMB3, Laminin subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB3Q13751 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LAMB3Q13751 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LAMB3Q13751 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms