Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDH18Q13634 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CDH18Q13634 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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