Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CUL1Q13616 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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