Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LMAN2Q12907 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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