Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CYP4F3Q08477 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms