Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
IRF8Q02556 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms