Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BNC1Q01954 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms