Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NUP107P57740 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms