Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
BRCA2P51587 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms