Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCT8P50990 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCT8P50990 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms