Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ETV4P43268 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ETV4P43268 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ETV4P43268 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ETV4P43268 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms