Protein–RNA interactions for Protein: P41970

ELK3, ETS domain-containing protein Elk-3, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK3P41970 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK3P41970 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ELK3P41970 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ELK3P41970 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ELK3P41970 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms