Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXA6P31267 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXA6P31267 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms