Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NFKBIAP25963 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms