Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DPA1P20036 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms