Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATF3P18847 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF3P18847 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATF3P18847 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATF3P18847 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms