Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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