Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NME1P15531 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NME1P15531 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NME1P15531 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms