Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFTRP13569 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFTRP13569 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFTRP13569 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFTRP13569 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms