Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBL4AP11441 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms