Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C8orf89P0DMQ9 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms