Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYBBP04839 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYBBP04839 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYBBP04839 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYBBP04839 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYBBP04839 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CYBBP04839 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CYBBP04839 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CYBBP04839 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms