Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
E2F3O00716 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F3O00716 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F3O00716 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F3O00716 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
E2F3O00716 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
E2F3O00716 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms