Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DGG1 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B4DGG1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
B4DGG1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
B4DGG1 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms