Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAD54BQ9Y620 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms