Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAF6Q9Y4K3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms