Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM35Q9UPQ4 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms